De l’animal
à l’échantillon biologique
Caractériser et quantifier les différences entre individus, ainsi que les variations causées par des facteurs génétiques ou environnementaux, des pathologies ou des traitements.
Le service Phénotypage vous accompagne dans vos projets de recherche à travers la mise en œuvre d’un ensemble de prestations et d’expertises pour l’enregistrement de variables physiologiques chez le rongeur de laboratoire. Nous proposons des mesures in vivo, ainsi qu’ex vivo sur divers échantillons biologiques issus des modèles expérimentaux.
Via la plateforme Anexplo, le service est membre actif de l’Infrastructure de Recherche nationale Celphédia au sein de laquelle nous conduisons des projets de R&D en collaboration avec d’autres plateformes d’exploration fonctionnelle.
Nos expertises et nos spécificités
Exploration métabolique et cardiovasculaire
in vivo
Le service Phénotypage possède une expertise de longue date en métabolisme énergétique. Nous développons également notre offre en exploration cardiovasculaire, notamment en télémétrie.
Analyse de vos échantillons
ex vivo
Nous réalisons divers types d’analyses des échantillons issus de vos modèles expérimentaux : Biochimie classique, Dosages multiparamétriques de cytokines et métabolites, Hématologie, Détermination du contenu énergétique.
De la mise à disposition d’équipements à la collaboration scientifique
Selon les cas, notre équipe vous forme à l’utilisation d’un appareil en libre-service, réalise les expérimentations pour vous en prestation simple, prend en charge toute une partie de votre projet ou vous propose une collaboration scientifique.
Conseil et Formation
En fonction de votre besoin, nous vous accompagnons dans le choix des expérimentations à réaliser, le design de vos protocoles expérimentaux et l’analyse de vos résultats. Nous proposons aussi des formations aux principaux gestes techniques et à plusieurs procédures chirurgicales.
Maintien du statut sanitaire SPF
Les expérimentations in vivo sont réalisées en zone confinée, garantissant le maintien du statut sanitaire SPF des cohortes. Vos animaux peuvent ainsi être étudiés sur le long terme et retrouver leur zone d’hébergement habituelle après chaque expérimentation.
Nos prestations
Notre service est ouvert à tous les acteurs de la recherche académique et aux industriels.
Calorimétrie indirecte au repos
(Phenomaster System – TSE)
Enregistrer les échanges gazeux chez la souris. Analyser la dépense énergétique et les substrats métabolisés (quotient respiratoire) au regard de la prise alimentaire et de l’activité locomotrice spontanée.
Exercice sur tapis roulants
(Treadmills – TSE)
Entrainer une cohorte à la course. Déterminer la vitesse maximale de course et/ou l’endurance des souris.
Calorimétrie indirecte à l’exercice
(Calotreadmills – TSE)
Enregistrer les échanges gazeux chez la souris durant un exercice de course. Déterminer la VO2max.
Collecte et mesure des urines et des fèces
(Cages Métaboliques – TSE)
Collecter et mesurer la production d’urines et de fèces sur une période de 24h.
Analyse de la composition corporelle
(Minispec LF50 – Bruker)
Déterminer la composition corporelle par RMN sur souris éveillée (masse grasse, masse maigre, fluides corporels).
Télémétrie
(Implants PhysioTel – DSI)
Enregistrer différentes variables physiologiques (BP, ECG, Activité, T°C, selon l’implant) sans aucune contention.
Actes techniques sur le rongeur
Nous mettons notre expertise technique à votre service et réalisons à la demande des traitements, chirurgies, tests de tolérance au glucose, mesure de température, greffes de tumeurs et suivi du développement tumoral, nécropsies…
Analyses biochimiques
(Pentra 400 et Pentra C400 – HORIBA Medical)
Doser les métabolites, ions, enzymes dans le plasma sanguin ou les urines. Bilan lipidique, hépatique, glucidique, protéique…
Dosages mutliparamétriques
(MAGPIX – Luminex)
Réaliser le dosage simultané sur divers fluides biologiques, de plusieurs analytes (multiplexage) grâce à la technologie xMAP.
Analyses hématologiques
(DF56VET – DYMIND)
Réaliser une numération formule sanguine complète sur sang total (multi espèces, y compris humain).
Détermination du contenu énergétique brut
(Calorimètre C200 – IKA)
Mesurer à l’aide d’une bombe calorimétrique ou calorimètre, l’énergie restante dans les fèces, pour évaluer l’absorption intestinale.
Demander une prestation, un tarif, des précisions ?
Réserver un instrument en libre-service ?
(réservé aux utilisateurs formés)
Consulter le catalogue des prestations et règles d’utilisation du service
Maintien du statut sanitaire
tout au long de votre projet
Pour la reproductibilité des données, pour limiter les biais expérimentaux et faciliter les échanges et les collaborations, nous vous garantissons un statut sanitaire contrôlé.
Les équipements
du service
Minispec LF50 – Bruker
Déterminer la composition corporelle par RMN sur souris éveillée (masse grasse, masse maigre, fluides corporels).
Calorimètre C200 – IKA
Détermination du contenu énergétique brut
Mesurer à l’aide d’une bombe calorimétrique ou calorimètre, l’énergie restante dans les fèces, pour évaluer l’absorption intestinale.
DF56VET – DYMIND
Analyses hématologiques
Réaliser une numération formule sanguine complète sur sang humain et vétérinaire.
MAGPIX – Luminex
Dosages mutliparamétriques
Réaliser le dosage simultané sur divers fluides biologiques, de plusieurs analytes (multiplexage) grâce à la technologie xMAP.
Implants PhysioTel – Data Sciences International
Télémétrie
Enregistrer différentes variables physiologiques (BP, ECG, Activité, T°C, selon l’implant) sans aucune contention.
Cages Métaboliques – TSE
Collecte et mesure des urines et des fèces
Collecter et mesurer la production d’urines et de fèces sur une période de 24h.
Calotreadmills – TSE
Enregistrer les échanges gazeux chez la souris durant un exercice de course.
Treadmills – TSE
Exercice sur tapis roulants pour Déterminer la vitesse maximale de course et/ou l’endurance des souris.
Phenomaster System – TSE
Enregistrer les échanges gazeux chez la souris. Analyser la dépense énergétique et les substrats métabolisés (quotient respiratoire) au regard de la prise alimentaire et de l’activité locomotrice spontanée.
Pentra 400 et Pentra C400 – HORIBA Medical
Analyses biochimiques Doser les métabolites, ions, enzymes dans le plasma sanguin ou les urines. Bilan lipidique, hépatique, glucidique, protéique…
Nos projets R&D
Refinement of indirect calorimetry experiments
En collaboration avec l’Institut Clinique de la Souris, le Chronobiotron et la plateforme AniRA, cette étude vise à contrebalancer l’effet stressant de l’isolement social lié aux protocoles actuels de calorimétrie indirecte et donc à améliorer le bien-être des animaux. Nous évaluons les impacts et avantages scientifiques de plusieurs types d’enrichissements placés dans les cages de calorimétrie et de l’enregistrement en groupe dans le cadre de ces expériences.
LMT Xp manager: a tool to manage and analyze behavioral studies using Live Mouse Tracker system
Le Service Phénotypage est impliqué, avec l’Institut Clinique de la Souris et le Chronobiotron, dans un projet de développement, test et déploiement d’un outil informatique permettant d’extraire de manière correcte et simple l’énorme quantité de données de base issues du système d’analyse du comportement, Live Mouse Tracker. L’outil doit permettre la vérification de l’intégrité des données, la gestion des expériences, et la primo-analyse des données.
Optimization of the EMG measurements in mice
Le Service Phénotypage participe, avec l’Institut Clinique de la Souris et la plateforme AniRA à un projet d’amélioration de protocole d’enregistrement EMG afin de détecter correctement l’onde réflexe H, difficilement observable.
Enseignement
à l’université
Les membres du service contribuent à l’enseignement dans plusieurs Masters de l’Université Paul Sabatier de Toulouse ainsi que dans la formation « Ethique et intégrité scientifique » de l’Université Fédérale de Toulouse.
Publications
Autonomic Nervous System Adaptation and Circadian Rhythm Disturbances of the Cardiovascular System in a Ground-Based Murine Model of Spaceflight.
Hélissen O, Kermorgant M, Déjean S, Mercadie A, Le Gonidec S, Zahreddine R, Calise D, Nasr N, Galès C, Arvanitis DN, Pavy-Le Traon A. Life (Basel). 2023 Mar 21;13(3):844. doi: 10.3390/life13030844.
The antitumoral activity of TLR7 ligands is corrupted by the microenvironment of pancreatic tumors.
Rouanet M, Hanoun N, Hubert Lulka, Ferreira C, Garcin P, Sramek M, Jacquemin G, Coste A, Pagan D, Valle C, Sarot E, Pancaldi V, Lopez F, Buscail L, Cordelier P. Mol Ther. 2022 Apr 6;30(4):1553-1563. doi: 10.1016/j.ymthe.2022.01.018. Epub 2022 Jan 14.
SHP2 drives inflammation-triggered insulin resistance by reshaping tissue macrophage populations.
Paccoud R, Saint-Laurent C, Piccolo E, Tajan M, Dortignac A, Pereira O, Le Gonidec S, Baba I, Gélineau A, Askia H, Branchereau M, Charpentier J, Personnaz J, Branka S, Auriau J, Deleruyelle S, Canouil M, Beton N, Salles JP, Tauber M, Weill J, Froguel P, Neel BG, Araki T, Heymes C, Burcelin R, Castan I, Valet P, Dray C, Gautier EL, Edouard T, Pradère JP, Yart A. Sci Transl Med. 2021 Apr 28;13(591):eabe2587. doi: 10.1126/scitranslmed.abe2587. Epub 2021 Apr 28.
Comment pouvons nous
vous aider ?
Vous souhaitez nous soumettre un projet, poser des questions sur les protocoles, les automates, demander une mise en autonomie sur un instrument ou une formation technique ?
Contactez-nous et nous vous aiderons à définir au mieux les objectifs, étudier la faisabilité technique, établir le cahier des charges et vous proposer une étude tarifaire sur-mesure. Le projet sera mis en œuvre après validation administrative, technique et éthique.
